MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Geobacter metallireducens GS-15 plasmid unnamed

Total Repeats: 218

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007515	TCAC	2	8	959	966	25 %	25 %	0 %	50 %	404494837
2	NC_007515	GCC	2	6	967	972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494837
3	NC_007515	T	6	6	1071	1076	0 %	100 %	0 %	0 %	404494837
4	NC_007515	GCC	2	6	1171	1176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494837
5	NC_007515	TCT	2	6	1297	1302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494837
6	NC_007515	CAC	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404494837
7	NC_007515	CAC	2	6	1357	1362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404494837
8	NC_007515	GCC	2	6	1366	1371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494837
9	NC_007515	TGT	2	6	1415	1420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494837
10	NC_007515	CAG	2	6	1436	1441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404494837
11	NC_007515	TGT	2	6	1459	1464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494837
12	NC_007515	A	6	6	1513	1518	100 %	0 %	0 %	0 %	404494837
13	NC_007515	CGG	2	6	1546	1551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494837
14	NC_007515	ATA	2	6	1674	1679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404494837
15	NC_007515	CAA	2	6	1815	1820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404494837
16	NC_007515	T	6	6	1830	1835	0 %	100 %	0 %	0 %	404494837
17	NC_007515	T	6	6	1854	1859	0 %	100 %	0 %	0 %	404494837
18	NC_007515	GCC	2	6	1951	1956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494837
19	NC_007515	TCT	2	6	1979	1984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494837
20	NC_007515	AAG	2	6	2126	2131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404494838
21	NC_007515	CTT	3	9	2183	2191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494838
22	NC_007515	AAT	2	6	2199	2204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404494838
23	NC_007515	GTTG	2	8	2413	2420	0 %	50 %	50 %	0 %	404494839
24	NC_007515	CTT	2	6	2543	2548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494839
25	NC_007515	CCA	2	6	2560	2565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404494839
26	NC_007515	AGAT	2	8	2568	2575	50 %	25 %	25 %	0 %	404494839
27	NC_007515	TGAC	2	8	2611	2618	25 %	25 %	25 %	25 %	404494839
28	NC_007515	GCT	2	6	2686	2691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494839
29	NC_007515	GTT	2	6	2729	2734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494839
30	NC_007515	GAA	2	6	2924	2929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404494839
31	NC_007515	TGGA	2	8	2943	2950	25 %	25 %	50 %	0 %	404494839
32	NC_007515	CCG	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494839
33	NC_007515	GCT	2	6	3235	3240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494839
34	NC_007515	CAC	2	6	3331	3336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404494839
35	NC_007515	TGG	2	6	3363	3368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404494839
36	NC_007515	CAGG	2	8	3374	3381	25 %	0 %	50 %	25 %	404494839
37	NC_007515	GCCA	2	8	3407	3414	25 %	0 %	25 %	50 %	404494839
38	NC_007515	CTT	2	6	3458	3463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494839
39	NC_007515	GTT	2	6	3532	3537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494839
40	NC_007515	TCAT	2	8	3862	3869	25 %	50 %	0 %	25 %	404494840
41	NC_007515	GGC	3	9	3934	3942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494840
42	NC_007515	TTC	2	6	3982	3987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494840
43	NC_007515	GCG	2	6	3992	3997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494840
44	NC_007515	CCT	2	6	4079	4084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404494841
45	NC_007515	CAA	2	6	4220	4225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404494841
46	NC_007515	C	8	8	4257	4264	0 %	0 %	0 %	100 %	404494841
47	NC_007515	C	7	7	4314	4320	0 %	0 %	0 %	100 %	404494841
48	NC_007515	C	6	6	4340	4345	0 %	0 %	0 %	100 %	404494841
49	NC_007515	CTTT	2	8	4643	4650	0 %	75 %	0 %	25 %	404494842
50	NC_007515	TTC	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494842
51	NC_007515	CGG	2	6	4800	4805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494843
52	NC_007515	TCT	2	6	4842	4847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494843
53	NC_007515	TGA	2	6	4855	4860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404494843
54	NC_007515	CTT	2	6	5003	5008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494843
55	NC_007515	GCG	2	6	5022	5027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494843
56	NC_007515	TCA	2	6	5060	5065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404494844
57	NC_007515	CTT	2	6	5066	5071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494844
58	NC_007515	GTC	2	6	5145	5150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494844
59	NC_007515	CAA	2	6	5159	5164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404494844
60	NC_007515	CCGG	2	8	5193	5200	0 %	0 %	50 %	50 %	404494844
61	NC_007515	GGA	2	6	5370	5375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404494845
62	NC_007515	CGG	2	6	5506	5511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494845
63	NC_007515	T	6	6	5559	5564	0 %	100 %	0 %	0 %	404494845
64	NC_007515	TCA	2	6	5665	5670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404494845
65	NC_007515	CGG	2	6	5674	5679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494845
66	NC_007515	TTTTCG	2	12	5694	5705	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	404494845
67	NC_007515	T	6	6	5708	5713	0 %	100 %	0 %	0 %	404494845
68	NC_007515	GAC	2	6	5758	5763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404494845
69	NC_007515	GGC	2	6	5780	5785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494845
70	NC_007515	CTT	2	6	6014	6019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494846
71	NC_007515	GTA	2	6	6026	6031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404494846
72	NC_007515	T	7	7	6042	6048	0 %	100 %	0 %	0 %	404494846
73	NC_007515	CCG	2	6	6103	6108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494846
74	NC_007515	TTG	2	6	6126	6131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494846
75	NC_007515	CAAC	2	8	6139	6146	50 %	0 %	0 %	50 %	404494846
76	NC_007515	AAC	2	6	6158	6163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404494846
77	NC_007515	ATA	2	6	6177	6182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404494846
78	NC_007515	T	6	6	6188	6193	0 %	100 %	0 %	0 %	404494846
79	NC_007515	T	6	6	6240	6245	0 %	100 %	0 %	0 %	404494847
80	NC_007515	CGG	2	6	6320	6325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
81	NC_007515	GGC	2	6	6330	6335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
82	NC_007515	TTG	2	6	6362	6367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494847
83	NC_007515	CTG	2	6	6375	6380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494847
84	NC_007515	GTT	2	6	6392	6397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494847
85	NC_007515	CCA	2	6	6401	6406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404494847
86	NC_007515	GCG	2	6	6433	6438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
87	NC_007515	GCG	2	6	6466	6471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
88	NC_007515	GCG	2	6	6502	6507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
89	NC_007515	ACGG	2	8	6540	6547	25 %	0 %	50 %	25 %	404494847
90	NC_007515	GCT	2	6	6557	6562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494847
91	NC_007515	GGC	2	6	6573	6578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
92	NC_007515	GCG	2	6	6583	6588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
93	NC_007515	GGC	2	6	6615	6620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
94	NC_007515	GTAA	2	8	6669	6676	50 %	25 %	25 %	0 %	404494847
95	NC_007515	TCT	2	6	6686	6691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494847
96	NC_007515	CGG	2	6	6812	6817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
97	NC_007515	CTG	2	6	6837	6842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494847
98	NC_007515	TTG	2	6	6893	6898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494847
99	NC_007515	TCAGGA	2	12	6920	6931	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404494847
100	NC_007515	T	6	6	6948	6953	0 %	100 %	0 %	0 %	404494847
101	NC_007515	GTT	2	6	7039	7044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494848
102	NC_007515	CTG	2	6	7112	7117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
103	NC_007515	GCT	2	6	7133	7138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
104	NC_007515	CGG	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
105	NC_007515	C	6	6	7163	7168	0 %	0 %	0 %	100 %	404494848
106	NC_007515	GCT	2	6	7196	7201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
107	NC_007515	CCG	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494848
108	NC_007515	GGT	2	6	7259	7264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404494848
109	NC_007515	GGT	2	6	7310	7315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404494848
110	NC_007515	CTG	2	6	7318	7323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
111	NC_007515	CCGGTG	2	12	7324	7335	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	404494848
112	NC_007515	CTG	2	6	7363	7368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
113	NC_007515	GCT	2	6	7377	7382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
114	NC_007515	CGG	2	6	7387	7392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
115	NC_007515	GCT	2	6	7403	7408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
116	NC_007515	CGG	2	6	7450	7455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
117	NC_007515	GGC	2	6	7475	7480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
118	NC_007515	CTG	2	6	7510	7515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
119	NC_007515	GCT	3	9	7554	7562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
120	NC_007515	CTG	2	6	7594	7599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
121	NC_007515	GCG	2	6	7620	7625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
122	NC_007515	TGC	3	9	7637	7645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
123	NC_007515	GCG	2	6	7650	7655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
124	NC_007515	CGG	3	9	7672	7680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
125	NC_007515	CGG	2	6	7684	7689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
126	NC_007515	CGG	2	6	7714	7719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
127	NC_007515	TCA	2	6	7780	7785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404494848
128	NC_007515	CCA	2	6	7849	7854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404494848
129	NC_007515	ATT	2	6	7890	7895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404494848
130	NC_007515	GAT	2	6	7955	7960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404494848
131	NC_007515	GAC	2	6	8018	8023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404494848
132	NC_007515	TGT	2	6	8094	8099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494848
133	NC_007515	CAG	2	6	8119	8124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404494848
134	NC_007515	CCG	2	6	8134	8139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494848
135	NC_007515	GAT	2	6	8222	8227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404494848
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.